Emtree

Emtree — это тезаурус биомедицинских терминов, разработанный и поддерживаемый издательской компанией Elsevier. Он используется для индексации и поиска научной литературы в библиографической базе данных Embase, а также в других информационных продуктах Elsevier, таких как Scopus. Emtree представляет собой контролируемый словарь, обеспечивающий единообразное описание содержания научных статей, патентов, докладов конференций и других документов в области медицины, биологии, фармакологии и смежных дисциплин.

История и развитие

Emtree был создан в 1970-х годах одновременно с запуском базы данных Embase (Excerpta Medica Database). Изначально тезаурус насчитывал около 20 000 терминов и был ориентирован преимущественно на фармакологию и токсикологию. С расширением Embase на другие области биомедицины, включая сестринское дело, стоматологию, ветеринарию и общественное здравоохранение, Emtree также пополнялся новыми понятиями.

Ключевые этапы развития:

• 1974 год — первая версия Emtree, выпущенная вместе с Embase.
• 1990-е годы — интеграция тезауруса с системой поиска на CD-ROM, а затем с веб-интерфейсом.
• 2000-е годы — регулярное обновление (дважды в год) с добавлением новых терминов, отражающих современные научные достижения (например, генная терапия, CRISPR, COVID-19).
• 2010-е годы — расширение охвата за счёт включения терминов из смежных областей (биоинформатика, медицинская физика, общественное здоровье).

На 2024 год Emtree содержит более 80 000 предпочтительных терминов (дескрипторов) и около 300 000 синонимов (включая аббревиатуры, варианты написания, торговые названия лекарств). Обновления выходят два раза в год — в январе и июле.

Структура и принципы организации

Emtree организован как иерархический тезаурус, где термины связаны родовидовыми отношениями («вышестоящий — нижестоящий»). Верхний уровень иерархии состоит из 15 основных категорий (например, «Анатомия», «Болезни», «Лекарственные средства», «Химические соединения», «Процедуры»). Каждая категория делится на подкатегории, вплоть до конкретных терминов.

Типы терминов

• Дескрипторы (Descritors) — основные, предпочтительные термины, используемые для индексации. Например, «Myocardial Infarction» (инфаркт миокарда) является дескриптором.
• Синонимы (Synonyms) — альтернативные названия, которые ведут к дескриптору. Например, «Heart attack» — синоним для «Myocardial Infarction».
• Квази-синонимы (Quasi-synonyms) — термины, близкие по смыслу, но не являющиеся точными синонимами (например, «Stroke» и «Cerebrovascular accident»).
• Нежелательные термины (Non-descriptors) — устаревшие или неточные названия, которые не используются для индексации, но могут встречаться в запросах пользователей.

Связи между терминами

• BT (Broader Term) — вышестоящий термин (например, «Cardiovascular Diseases» — BT для «Myocardial Infarction»).
• NT (Narrower Term) — нижестоящий термин (например, «Acute Myocardial Infarction» — NT для «Myocardial Infarction»).
• RT (Related Term) — связанный термин, не находящийся в прямой иерархии (например, «Coronary Artery Bypass» — RT для «Myocardial Infarction»).
• UF (Used For) — указывает, что данный термин используется вместо другого (например, «Myocardial Infarction» UF «Heart attack»).

Подкатегории и фасеты

Для более точной индексации Emtree использует систему подкатегорий (subheadings) — специальных пометок, уточняющих аспект термина. Например, к дескриптору «Drug Therapy» могут быть добавлены подкатегории «Adverse Effects» (побочные эффекты), «Contraindications» (противопоказания) или «Drug Interactions» (лекарственные взаимодействия). Всего существует около 200 подкатегорий, разделённых на 15 групп (например, «Diagnosis», «Therapy», «Prevention», «Etiology»).

Применение

Emtree является ключевым инструментом для поиска в Embase — одной из крупнейших библиографических баз данных по биомедицине, содержащей более 40 миллионов записей (на 2024 год). Использование тезауруса позволяет:

• Повысить точность поиска — пользователь может выбрать дескриптор, а не полагаться на случайные ключевые слова. Например, поиск по «Myocardial Infarction» найдёт все статьи, где этот термин использован для индексации, независимо от того, какие синонимы (heart attack, MI, infarctus myocardii) встречаются в тексте.
• Расширить поиск — иерархия позволяет автоматически включать все нижестоящие термины (например, при поиске «Cardiovascular Diseases» будут найдены статьи по «Myocardial Infarction», «Hypertension», «Heart Failure» и т.д.).
• Фильтровать результаты — с помощью подкатегорий можно сузить поиск по конкретным аспектам (например, только по диагностике или лечению).

Emtree также используется в других продуктах Elsevier:

• Scopus — часть терминов Emtree применяется для индексации медицинских статей.
• ClinicalKey — поисковая система для клинической практики.
• PharmaPendium — база данных по безопасности лекарств.

Сравнение с другими тезаурусами

Emtree часто сравнивают с MeSH (Medical Subject Headings) — тезаурусом Национальной медицинской библиотеки США, используемым в PubMed. Основные различия:

Emtree считается более детализированным в области фармакологии и клинических испытаний, тогда как MeSH — более универсальным и широко используемым в академической среде.

Критика и ограничения

Основные замечания к Emtree связаны с его коммерческим характером:

• Платность — доступ к Emtree возможен только через подписку на Embase или другие продукты Elsevier. Это ограничивает его использование в некоммерческих организациях и развивающихся странах.
• Зависимость от Elsevier — тезаурус развивается в соответствии с интересами издательства, что может приводить к неравномерному охвату некоторых областей (например, традиционной медицины или редких заболеваний).
• Сложность — для эффективного использования Emtree требуется обучение, особенно в части подкатегорий и правил индексации. Новички могут испытывать трудности с формулировкой запросов.

Тем не менее, Emtree остаётся одним из наиболее полных и структурированных тезаурусов в биомедицине, особенно для поиска по фармакологической и клинической литературе.

Интересные факты

• Emtree содержит специальные термины для обозначения типов клинических исследований (например, «Randomized Controlled Trial», «Cohort Study»), что облегчает поиск по методологии.
• В 2020 году, в связи с пандемией COVID-19, в Emtree были добавлены сотни новых терминов, включая «SARS-CoV-2», «COVID-19», «Spike Protein», «Vaccine Efficacy».
• Emtree поддерживает многоязычный поиск: пользователь может вводить запросы на английском, немецком, французском, испанском и других языках, которые автоматически переводятся на английские дескрипторы.
• Некоторые термины Emtree имеют примечания (scope notes), поясняющие их значение и область применения, что особенно полезно для начинающих индексаторов.

Источники

• Emtree User Guide. Elsevier, 2024.
• Embase: A Biomedical Database. Elsevier, 2023.
• Сравнительный анализ тезаурусов MeSH и Emtree. Journal of Medical Library Association, 2022.
• Официальный сайт Embase: embase.com.