Спектроскопия кругового дихроизма
Спектроскопия кругового дихроизма — это метод оптической спектроскопии, основанный на измерении разности поглощения лево- и правополяризованного по кругу света образцом. Данный эффект, известный как круговой дихроизм (КД), возникает в оптически активных хиральных молекулах или структурах, которые по-разному взаимодействуют с двумя поляризациями. Спектроскопия КД широко применяется в биофизике, химии и фармацевтике для изучения вторичной структуры биополимеров (белков, нуклеиновых кислот), определения абсолютной конфигурации хиральных соединений и анализа межмолекулярных взаимодействий.
Физические основы
Круговой дихроизм является проявлением оптической активности — свойства вещества вращать плоскость поляризации проходящего света. В отличие от обычного поглощения, где измеряется только интенсивность прошедшего света, в спектроскопии КД регистрируется разность поглощения (ΔA) между лево- (L) и правополяризованным (R) светом:
\[ \Delta A = A_L - A_R \]
Эта разность связана с молярным коэффициентом экстинкции (Δε) и концентрацией образца (c) через закон Бера-Ламберта-Бугера:
\[ \Delta A = \Delta \varepsilon \cdot c \cdot l \]
где \(l\) — длина оптического пути. Для практических измерений часто используют эллиптичность (θ), выраженную в миллиградусах (мград), которая связана с ΔA соотношением:
\[ \theta (\text{мград}) = 32980 \cdot \Delta A \]
Спектроскопия КД чувствительна к хиральности — свойству молекул не совпадать со своим зеркальным отражением. Хиральные молекулы (например, аминокислоты L-ряда, сахара D-ряда) имеют различные дипольные моменты переходов для лево- и правополяризованного света, что и приводит к возникновению сигнала КД.
Историческое развитие
Первые наблюдения кругового дихроизма относятся к середине XIX века, когда французский физик Эмиль Верде в 1852 году обнаружил различие в поглощении поляризованного света растворами хиральных веществ. Однако систематическое развитие метода началось в 1950-х годах, когда были созданы первые коммерческие спектрополяриметры. В 1960-х годах американский биохимик Джон Шеллман и его коллеги применили спектроскопию КД для изучения вторичной структуры белков, что стало прорывом в структурной биологии. В 1970-х годах метод был усовершенствован с появлением синхротронных источников света, что позволило расширить спектральный диапазон в вакуумную ультрафиолетовую область. В России значительный вклад в развитие спектроскопии КД внесли работы учёных Института биоорганической химии РАН и Московского государственного университета.
Аппаратура и методика
Основным прибором для спектроскопии КД является спектрополяриметр (дихрограф). Ключевые компоненты установки:
- Источник света: ксеноновая дуговая лампа высокого давления (диапазон 180–800 нм) или синхротронное излучение (для дальнего УФ).
- Монохроматор: выделяет узкую спектральную полосу (обычно двойной монохроматор для снижения рассеянного света).
- Поляризатор: создаёт линейно-поляризованный свет (например, призма Глана-Тейлора).
- Модулятор поляризации: фотоупругий модулятор (PEM), работающий на частоте 50 кГц, преобразует линейную поляризацию в лево- и правополяризованную по кругу с частотой модуляции.
- Кюветное отделение: термостатируемая ячейка с образцом (обычно кварцевая кювета с длиной оптического пути 0,1–10 мм).
- Детектор: фотоумножитель или фотодиод, регистрирующий интенсивность прошедшего света.
- Электроника: синхронный усилитель (lock-in amplifier), выделяющий переменную составляющую сигнала на частоте модуляции, пропорциональную ΔA.
Измерения проводятся в диапазоне длин волн от 170 до 800 нм. Для работы в дальнем УФ (ниже 200 нм) требуется продувка прибора азотом или аргоном для удаления кислорода, поглощающего свет. Образцы должны быть оптически прозрачными, без пузырьков и взвесей. Концентрация белков обычно составляет 0,1–1 мг/мл, для нуклеиновых кислот — 0,01–0,1 мг/мл.
Применение в биофизике
Определение вторичной структуры белков
Спектроскопия КД в дальнем УФ (190–250 нм) является стандартным методом оценки вторичной структуры белков. Различные типы вторичных структур дают характерные спектры:
- α-спираль: два отрицательных пика при 208 и 222 нм и положительный пик при 192 нм.
- β-лист: отрицательный пик при 215–218 нм и положительный при 195–200 нм.
- Неупорядоченная структура (random coil): отрицательный пик при 195–200 нм и слабый положительный сигнал выше 210 нм.
Для количественного анализа применяют методы деконволюции спектров, такие как алгоритм SELCON3, CONTIN-LL или CDSSTR, которые сравнивают экспериментальный спектр с базой данных спектров белков известной структуры. Точность определения доли α-спиралей составляет ±5%, β-листов — ±10%.
Изучение нуклеиновых кислот
КД-спектроскопия позволяет различать формы ДНК (A, B, Z) и РНК, а также анализировать их взаимодействие с лигандами. Например, B-форма ДНК даёт характерный положительный пик при 275 нм и отрицательный при 245 нм, тогда как Z-форма имеет противоположный знак сигнала. Метод также используется для изучения плавления ДНК (денатурации) и образования тройных спиралей.
Фолдинг и стабильность белков
Изменение сигнала КД при нагревании или добавлении денатурантов (мочевина, гуанидинхлорид) позволяет отслеживать процесс разворачивания белков. Кривые плавления, построенные по зависимости эллиптичности при 222 нм от температуры, дают термодинамические параметры (температуру плавления Tm, энтальпию ΔH). Это важно для оценки стабильности белков в фармацевтических препаратах.
Применение в химии и фармацевтике
Определение абсолютной конфигурации
Для хиральных органических молекул (например, природных соединений, лекарственных веществ) спектроскопия КД в сочетании с квантово-химическими расчётами позволяет установить абсолютную конфигурацию (R/S). Метод особенно эффективен для соединений с хромофорами, поглощающими в УФ-области (карбонильные группы, ароматические кольца). Сравнение экспериментального спектра КД с рассчитанным для предполагаемых энантиомеров даёт однозначный ответ.
Контроль качества лекарств
В фармацевтической промышленности спектроскопия КД используется для проверки оптической чистоты субстанций. Наличие примесей другого энантиомера (например, S-изомера в препарате R-изомера) приводит к изменению сигнала КД. Чувствительность метода позволяет обнаруживать до 0,5% примесей. Метод также применяется для анализа конформационных изменений белковых лекарств (например, моноклональных антител) при хранении.
Ограничения и критика
Спектроскопия КД имеет ряд ограничений:
- Требования к образцу: раствор должен быть оптически прозрачным, без агрегатов и пузырьков. Мутные образцы (например, липосомы, клеточные экстракты) дают сильное рассеяние света, искажающее спектр.
- Чувствительность к концентрации: для точных измерений необходима точная концентрация образца, так как сигнал КД пропорционален ей.
- Спектральные ограничения: в области ниже 190 нм поглощение воды и кислорода делает измерения сложными (требуется вакуум или продувка азотом).
- Интерпретация спектров: для сложных смесей (например, многокомпонентные белковые комплексы) деконволюция спектров может быть неоднозначной.
- Сравнение с другими методами: спектроскопия КД даёт усреднённую информацию о вторичной структуре, в отличие от рентгеноструктурного анализа или ЯМР-спектроскопии, которые обеспечивают атомарное разрешение.
Несмотря на эти ограничения, метод остаётся незаменимым для быстрой оценки конформационных изменений в биомолекулах, особенно в условиях, где другие методы неприменимы (например, при низких концентрациях или в растворе).
Интересные факты
- Спектроскопия КД чувствительна к хиральности, поэтому она не может быть применена к ахиральным молекулам (например, метану или бензолу без заместителей).
- В 1960-х годах метод использовался для доказательства того, что природные белки состоят исключительно из L-аминокислот, а нуклеиновые кислоты — из D-сахаров.
- Современные спектрополяриметры способны измерять сигналы КД с точностью до 0,1 миллиградуса, что соответствует разности поглощения порядка 10⁻⁶ оптических единиц.
- В России спектроскопия КД активно применяется в Институте биоорганической химии РАН и на кафедре биофизики МГУ для изучения структуры мембранных белков и вирусных частиц.
Источники
- Berova N., Nakanishi K., Woody R. W. Circular Dichroism: Principles and Applications. — 2nd ed. — Wiley-VCH, 2000.
- Kelly S. M., Jess T. J., Price N. C. How to study proteins by circular dichroism // Biochimica et Biophysica Acta. — 2005. — Vol. 1751, No. 2. — P. 119–139.
- Greenfield N. J. Using circular dichroism spectra to estimate protein secondary structure // Nature Protocols. — 2006. — Vol. 1, No. 6. — P. 2876–2890.
- Woody R. W. Circular dichroism of peptides and proteins // Methods in Enzymology. — 1995. — Vol. 246. — P. 34–71.
- Johnson W. C. Jr. Protein secondary structure and circular dichroism: a practical guide // Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. — 1990. — Vol. 7, No. 3. — P. 205–214.
BFOmetr — база данных и аналитика по компаниям России.
На главную BFOmetr →