Штамм Дельта¶

Штамм Дельта — это линия коронавируса SARS-CoV-2, относящаяся к вариантам, вызывающим озабоченность (VOC). Впервые идентифицирован в Индии в конце 2020 года, получил научное обозначение B.1.617.2 и название «Дельта» по букве греческого алфавита, присвоенное Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) в мае 2021 года. Штамм характеризовался повышенной трансмиссивностью, частичным уходом от иммунного ответа и более тяжёлым течением заболевания по сравнению с исходным уханьским штаммом, что привело к новой глобальной волне пандемии COVID-19 в 2021 году.

¶История и происхождение

¶Первое обнаружение

В декабре 2020 года в индийском штате Махараштра у пациентов с COVID-19 был выявлен новый вариант коронавируса, содержащий несколько мутаций в S-белке. 5 апреля 2021 года ВОЗ классифицировала его как вариант, вызывающий озабоченность (VOC), и присвоила обозначение B.1.617.2. К этому моменту штамм уже стал доминирующим в Индии, где в апреле-мае 2021 года разразилась катастрофическая вторая волна пандемии.

¶Распространение по миру

Благодаря высокой заразности, штамм Дельта быстро вытеснил другие варианты, включая Альфа (B.1.1.7), ранее доминировавший в Европе и Северной Америке. К лету 2021 года он стал преобладающим в Великобритании, США, России и большинстве стран мира. В России первый случай заражения штаммом Дельта был зафиксирован в апреле 2021 года, а к июню он составлял уже более 90% всех новых случаев COVID-19.

¶Конец доминирования

С конца 2021 года штамм Дельта начал вытесняться новым, ещё более заразным вариантом Омикрон (B.1.1.529), который обладал значительно большей способностью уклоняться от иммунитета, хотя и вызывал в среднем менее тяжёлое течение болезни. К началу 2022 года Дельта перестал быть доминирующим штаммом, однако его субварианты продолжали циркулировать на низком уровне.

¶Классификация и мутации

¶Систематика

Штамм Дельта относится к линии B.1.617.2 в рамках филогенетической классификации коронавирусов. ВОЗ выделила несколько его субвариантов, обозначаемых дополнительными буквами: AY.1, AY.2, AY.3 и далее, которые отличались незначительными дополнительными мутациями, но не меняли общих свойств.

¶Ключевые мутации

Основные отличия штамма Дельта от исходного вируса заключались в мутациях в гене S-белка (шипа), который отвечает за проникновение вируса в клетки человека:

• L452R — мутация в рецептор-связывающем домене (RBD), повышающая сродство к рецептору ACE2 и снижающая нейтрализацию некоторыми антителами.
• P681R — мутация в сайте фуринового расщепления, облегчающая слияние вирусной мембраны с мембраной клетки, что увеличивает заразность.
• T478K — мутация в RBD, дополнительно усиливающая связывание с рецептором и уход от иммунного ответа.
• D614G — мутация, присутствовавшая уже у многих ранних вариантов, стабилизирующая S-белок.

¶Характеристики и особенности

¶Трансмиссивность

Штамм Дельта был примерно на 60–80% заразнее исходного уханьского штамма и на 40–60% заразнее варианта Альфа. По оценкам, базовое репродуктивное число (R0) для Дельты составляло от 5 до 8, что означало, что один инфицированный в среднем заражал 5–8 человек в полностью восприимчивой популяции (для сравнения, у исходного штамма R0 было около 2,5–3).

¶Тяжесть течения болезни

Многочисленные исследования, в том числе проведённые в Великобритании, Канаде и Сингапуре, показали, что заражение штаммом Дельта приводило к более высокому риску госпитализации (в 1,5–2 раза выше по сравнению с вариантом Альфа) и более тяжёлому течению заболевания. У пациентов чаще развивалась пневмония, требовалась кислородная поддержка и искусственная вентиляция лёгких. Смертность также была несколько выше, хотя точные цифры варьировались в зависимости от популяции и уровня вакцинации.

¶Симптоматика

Симптомы COVID-19, вызванного штаммом Дельта, в целом были схожи с классическими, но имели некоторые особенности. Чаще отмечались головная боль, боль в горле, насморк и лихорадка. Потеря обоняния и вкуса, характерная для ранних штаммов, встречалась реже. Инкубационный период сократился до 3–4 дней (против 5–6 у исходного штамма), что способствовало более быстрому распространению.

¶Влияние на вакцинацию и иммунитет

¶Эффективность вакцин

Штамм Дельта продемонстрировал способность частично уклоняться от иммунного ответа, выработанного после вакцинации или перенесённого заболевания. Эффективность двухдозовых схем вакцин (например, Pfizer/BioNTech, Moderna, AstraZeneca, «Спутник V») против заражения штаммом Дельта снижалась до 60–80% (по сравнению с 90–95% против исходного штамма). Однако вакцины сохраняли высокую эффективность (80–95%) против тяжёлого течения болезни, госпитализации и смерти. Для поддержания защиты было рекомендовано проведение бустерной (третьей) дозы.

¶Повторные заражения

У переболевших другими штаммами (включая исходный и Альфа) риск повторного заражения Дельтой был выше, чем риск заражения тем же штаммом, но всё же значительно ниже, чем у невакцинированных. Иммунитет после перенесённого заболевания Дельтой обеспечивал более надёжную защиту от повторного заражения этим же вариантом, но не от последующих (например, Омикрона).

¶Меры противодействия

¶Немедикаментозные меры

В связи с повышенной заразностью Дельты, многие страны ужесточили ограничения: ношение масок, социальное дистанцирование, ограничение массовых мероприятий, введение QR-кодов для доступа в общественные места. Эффективность этих мер была подтверждена, но их соблюдение требовало более строгого контроля.

¶Лечение

Терапия COVID-19, вызванного штаммом Дельта, в целом не отличалась от стандартной. Использовались противовирусные препараты (например, ремдесивир), кортикостероиды (дексаметазон), моноклональные антитела (которые, однако, были менее эффективны против этого варианта, чем против исходного). В тяжёлых случаях применялась кислородотерапия и ИВЛ.

¶Критика и споры

¶Происхождение

Существовали предположения, что штамм Дельта мог возникнуть в условиях недостаточного геномного надзора и низкого охвата вакцинацией в Индии, что позволило вирусу длительно циркулировать и накапливать мутации. Однако точные причины его появления остаются предметом научных дискуссий.

¶Название

Использование греческих букв для обозначения вариантов вызвало критику со стороны некоторых экспертов, указывавших на возможную стигматизацию стран, где вариант был впервые обнаружен (в данном случае — Индии). ВОЗ, тем не менее, сочла такой подход более нейтральным, чем географические названия.

¶Интересные факты

• Штамм Дельта был первым вариантом, который получил буквенное обозначение по новой системе ВОЗ, введённой в мае 2021 года.
• В некоторых странах, например, в Австралии и Новой Зеландии, которые ранее успешно сдерживали пандемию, появление Дельты привело к самым длительным и жёстким локдаунам за весь период пандемии.
• Исследования показали, что вирусная нагрузка у пациентов, инфицированных Дельтой, была примерно в 1000 раз выше, чем у заражённых исходным штаммом, что объясняло его сверхзаразность.

¶Источники

• Всемирная организация здравоохранения (WHO). «Tracking SARS-CoV-2 variants». 2021.
• Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC). «SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions». 2021.
• Научные публикации в журналах Nature, The Lancet, New England Journal of Medicine (NEJM) за 2021 год.
• Данные Роспотребнадзора и Министерства здравоохранения Российской Федерации за 2021 год.
• Отчёты Public Health England (PHE) и UK Health Security Agency (UKHSA) о вариантах, вызывающих озабоченность.