Омикрон — вариант SARS-CoV-2¶

Омикрон (обозначение ВОЗ, греч. Ομικρόν; научное обозначение B.1.1.529) — вариант (штамм) вируса SARS-CoV-2, вызывающего COVID-19, впервые выявленный в ноябре 2021 года. Относится к варианту «высокой значимости» (VOC) по классификации Всемирной организации здравоохранения. Характеризуется аномально высокой контагиозностью и способностью к значительному уходу от иммунитета, при этом в целом ассоциирован с менее тяжёлым течением заболевания по сравнению с предшествующими вариантами, прежде всего дельтой.

¶Открытие и названия

Первые образцы вируса с последовательностью, соответствующей B.1.1.529, были получены в Ботсване и Южно-Африканской Республике в ноябре 2021 года. 24 ноября 2021 года Южно-Африканский институт инфекционных болезней сообщил о выявлении нового варианта с 32 мутациями в белке-спайке. 26 ноября 2021 года ВОЗ присвоила варианту греческое обозначение «омикрон» — следующее после «дельты» в алфавитном перечне, пропустив «ню» и «кси» по рекомендации консультативной группы ВОЗ, стремившейся избежать стигматизации стран.

В России первые случаи заражения омикроном были зарегистрированы в декабре 2021 года — 6 декабря в Москве у двух вернувшихся из ЮАР пациентов, затем в Санкт-Петербурге и других регионах. Уже к середине декабря 2021 года омикрон стал доминировать в Москве, вытеснив дельту за считаные недели.

¶Генетические особенности

Омикрон резко отличается от предшествующих вариантов по мутационному профилю. В его геноме (длиной около 30 тыс. нуклеотидов) насчитывается более 50 мутаций, из которых около 30 приходится на белок-спайк — структуру, через которую вирус связывается с рецептором ACE2 клетки-хозяина и которая является основной мишенью нейтрализующих антител.

Ключевые мутации спайка омикрона включают N501Y, K417N, E484A и др. Существенная часть мутаций сконцентрирована в рецептор-связывающем домене (RBD), что объясняет высокую способность к ускользанию от антител, выработанных после перенесённого COVID-19 или вакцинации. При этом омикрон слабее взаимодействует с клетками лёгких и активнее с клетками верхних дыхательных путей, что, по гипотезе ряда исследователей, связано с менее тяжёлым течением болезни.

¶Распространение

Омикрон демонстрировал беспрецедентную скорость распространения. По данным ВОЗ, к январю 2022 года он стал доминирующим вариантом в более чем 180 странах мира. Среднее время удвоения числа случаев инфекции, связанной с омикроном, составляло 2–3 дня, что значительно превышало показатели дельты.

В России пик омикронной волны пришёлся на конец января — начало февраля 2022 года: суточные приросты новых случаев превышали 200 тысяч, что стало рекордом за весь период пандемии. При этом доля госпитализаций и летальных исходов в расчёте на случай инфекции была существенно ниже, чем в предшествующие волны.

¶Клинические особенности

Заболевание, вызванное омикроном, в целом протекает легче, чем при дельте. Типичные симптомы: насморк, боль в горле, кашель, головная боль, утомляемость, мышечные боли. По сравнению с дельтой реже наблюдаются потеря обоняния и вкуса, а также тяжёлая пневмония. Однако абсолютное число тяжёлых случаев оставалось значительным из-за общей масштабности волны, а у невакцинированных и лиц с тяжёлыми сопутствующими заболеваниями омикрон мог вызывать серьёзные осложнения, включая «постковид».

¶Подварианты

Со временем омикрон разделился на множество сублинейностей. Наиболее значимые:

• BA.1 — исходный подвариант, доминировавший зимой 2021–2022 гг.
• BA.2 — «скрытый омикрон», более трансмиссибельный, доминировал весной 2022 года.
• BA.4 и BA.5 — доминировали летом 2022 года, обладали повышенной способностью к реинфекции.
• BQ.1, XBB и их производные — циркулировали в 2023 году.
• JN.1 — подвариант линии BA.2.86, стал доминирующим в конце 2023 — начале 2024 года.

Последующие подварианты омикрона постепенно вытеснили все прежние линии SARS-CoV-2, и с 2023 года все циркулирующие варианты коронавируса происходят от омикрона.

¶Вакцины и лечение

Исследования показали, что вакцины на основе мРНК (Pfizer/BioNTech, Moderna), а также векторные вакцины сохраняют эффективность против тяжёлого течения и смерти, хотя нейтрализующая активность сывороток в отношении омикрона существенно снижена. В России для профилактики применялись вакцины «Спутник V», «Спутник Лайт», «ЭпиВакКорона» и «КовиВак»; разрабатывались и обновлённые составы с учётом мутаций омикрона.

Из противовирусных препаратов против омикрона сохраняли активность ингибиторы протеазы (нирателавир/ритонавир), моноклональные антитела, однако часть из них (например, касиривимаб/имдевимаб) утратила эффективность именно из-за мутаций омикрона.

¶См. также

• COVID-19
• Варианты SARS-CoV-2
• Дельта (штамм вируса)
• Вакцинация против COVID-19 в России

¶Источники

• Всемирная организация здравоохранения. Регулярные обновления по вариантам SARS-CoV-2.
• Минздрав России. Оперативная информация по ситуации с COVID-19.
• Rambaut A. et al. A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages. Nature Microbiology, 2021.
• Viana R. et al. Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa. Nature, 2022.
• Тасс. Новости о распространении омикрона в России, декабрь 2021 — февраль 2022.